Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DNASE1L3Q13609 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DNASE1L3Q13609 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNASE1L3Q13609 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms