Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms