Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FOXE3Q13461 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXE3Q13461 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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