Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP4Q13115 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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