Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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