Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM2Q13029 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
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