Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NFIAQ12857 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms