Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROQ12816 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROQ12816 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROQ12816 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROQ12816 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROQ12816 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
TROQ12816 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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