Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SREBF2Q12772 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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