Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNA1Q09470 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNA1Q09470 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms