Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RBBP4Q09028 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms