Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABPB1Q06547 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms