Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms