Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDR2Q01850 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms