Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFI35P80217 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFI35P80217 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFI35P80217 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFI35P80217 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms