Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms