Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB4BP61018 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB4BP61018 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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