Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN17P56750 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN17P56750 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms