Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF1P55201 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms