Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23BP54727 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAD23BP54727 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms