Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA3P42263 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms