Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGAEP38570 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGAEP38570 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms