Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HPCAL1P37235 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms