Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TSPOP30536 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TSPOP30536 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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