Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms