Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSX1P28360 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSX1P28360 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSX1P28360 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSX1P28360 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSX1P28360 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSX1P28360 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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