Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMA4P25789 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms