Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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RAB5AP20339 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RAB5AP20339 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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