Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPI1P17947 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms