Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TPRP12270 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TPRP12270 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPRP12270 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPRP12270 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPRP12270 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TPRP12270 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TPRP12270 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TPRP12270 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms