Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COL6A2P12110 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms