Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms