Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms