Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1AO95602 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms