Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms