Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPSNAP2O75323 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms