Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms