Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SELENOFO60613 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms