Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HOXA2O43364 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA2O43364 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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