Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNMO15061 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNMO15061 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNMO15061 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms