Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHMG1C9JSJ3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms