Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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