Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NBASA2RRP1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms