Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms