Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms