Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RARRES3Q9UL19 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RARRES3Q9UL19 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms