Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MED13Q9UHV7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms