Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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