Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms