Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHPF2Q9P2E5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms